實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR，qPCR)是指在PCR體系中加入熒光染料或熒光探針，利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程，最后通過CT值和標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。具有PCR技術快速、靈敏的特點，同時還具有更高的特異性、實時監測和可重復精確定量等優勢。

　　熒光染料法：實驗設計簡單(僅需2個引物，無需設計探針)，初始成本低，靈敏度高，但需要進行熔解曲線分析檢驗擴增反應的特異性。適用于非特異性檢測(專一性要求不高或高通量檢測)。

　　探針法：有高特異性(引物和探針共同于模板結合)，高信噪比，能進行多重反應。但成本高，實驗設計繁瑣。適用于擴增序列專一檢測。