1.簡介
在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,z后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。分為SYBRGreen法與TaqMan探針法。
熒光染料法:實驗設計簡單(僅需2個引物,無需設計探針),初始成本低,靈敏度高,但需要進行熔解曲線分析檢驗擴增反應的特異性。適用于非特異性檢測(專一性要求不高或高通量檢測)。
探針法:有高特異性(引物和探針共同于模板結合),高信噪比,能進行多重反應。但成本高,實驗設計繁瑣。適用于擴增序列專一檢測。
2.服務流程
1. 送樣要求
(1)A:細胞、細菌、真菌、動植物組織等均可寄送,為了保證實驗要求,樣品數盡可能準備充足。

注意事項
1. 組織在1-2min內完成取材,速凍,并立即放入-80℃或液氮中保存。
2. 有條件的話,z好先將樣本在液氮中速凍,再轉入-80℃冰箱中保存。
3. 使用的凍存管z好也用DEPC處理。
4. 對于組織及細胞樣本,如果沒有液氮或-80℃冰箱,也可用RNAlater保存,但是組織一定要切成比較小的塊狀,-20℃保存運輸。
B:細胞沉淀:細胞量大于10^6的細胞/組;細菌沉淀:細菌量大于10^8的細菌/組;
C:土壤、污泥樣本:至少10g;
D:環境水樣:至少1L/組,寄送裝有過濾定量水樣的濾膜(4°C),干燥寄送。 如果其他樣品寄送需求,請與工作人員溝通確認!
(2)待測樣品為RNA樣品及cDNA樣本,RNA濃度不低于200ng/uL,DNA濃度不低于20ng/uL,核酸體積10uL/檢測基因,且樣品接收后需先進行質檢,質檢合格的開展后續項目(核酸樣本需包裝完整,離心管用封口膜封閉,干冰寄送)。
(3)不接受具有致病性的樣品。
(4)待測樣品(原始樣品或者RNA或者cDNA,原始樣品可由我們代處理,RNA樣品及cDNA樣本接收后需先進行質檢,質檢合格的開展后續項目);
(5)提供所需的引物/標準品(或平臺代設計及合成);提供檢測基因的序列和引物序列,若基因序列來自文獻等其他途徑,可以多參考幾組,避免引物特異性不足,延長實驗周期。
(6)其他所涉及的細胞、試劑盒以及生物耗材等平臺都可以有償提供。
1、熔解曲線出現雙峰的原因?
引物設計不夠優化:應避免引物二聚體和發夾結構的出現。
引物濃度不佳:適當降低引物的濃度,并注意上下游引物的濃度配比。
鎂離子濃度過高:適當降低鎂離子濃度,或選擇更合適的 mix 試劑盒。
模板有基因組的污染:RNA提取過程中避免基因組DNA的引入,或通過引物設計避免非特異擴增。
2、CT值出現太晚,偏大?
擴增效率低: 反應條件不夠優化。設計更好的引物或探針;改用三步法進行反應;適當降低退火溫度;增加鎂離子濃度等。
PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足。
PCR產物太長: 一般采用80-150bp的產物長度。
3、陰性對照出現明顯擴增
反應體系污染:更換新的Mix、ddH2O、引物重復實驗。反應體系在超凈工作臺內配制,減少氣溶膠污染。
引物二聚體的出現:配合熔解曲線進行分析。