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微生物平臺

菌株鑒定

儀器型號

Hitachi Regulus8100,Sigma 300;Zeiss Gemini 300; Hitachi S4800;JSM-7800F;蔡司 Supra 55等

預約次數:36871
新客專享:首單立減200元
測試收費:溝通
詳細介紹
 
項目介紹
 
采用測序方法對各種細菌16S rDNA或者真菌的 ITS進行了廣泛的研究,獲得了大量的DNA序列信息,保守序列區域反映了生物物種間的親緣關系,而高變序列區域則能體現物種間的差異。將測序得到的16S rDNA序列在NCBI上進行Blas比對,即可獲知與該序列同源性較高的已知序列,為確定菌種的分類學地位提供依據。
 
樣本要求
 
菌株:需要提供純化后的菌株,單克隆菌落(平板)或菌液(至少200uL),冰袋寄送
基因組DNA溶液:濃度≥50 ng/μL,總體積≥10μL,且純度達標(OD260/OD280在1.6-1.8之間),干冰寄送
 
結果展示
 
1. 交付內容
測序原始數據、比對結果、實驗報告
2. 測試周期
7個工作日左右
3. 結果展示(部分)
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以上內容僅供參考,具體以實際測試為準,不同儀器會有差異,需要了解詳細的結果形式,請聯系e測試工作人員
 
常見問題
 
question 
1、菌種鑒定可以鑒定到株嗎?
不能鑒定到株,菌種鑒定結果通過比對相似度超過99%一般定義為同一種菌
 question
2、PCR擴增切膠純化測序出現套峰是什么情況?
測序結果個別堿基出現N,或者部分連續出現套峰,是由菌種rDNA多態性造成,對菌種鑒定無影響;所有測序反應均出現大面積套峰,由于客戶提供樣品模板不純造成,這種情況需要客戶重新純化菌種
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