蛋白質相互作用的檢測方法多種多樣，常用的方法包括免疫共沉淀、酵母雙雜交、表面等離子共振、質譜分析等。這些方法各有優劣，可以根據實驗需求選擇合適的方法。

　　1.免疫共沉淀

　　免疫共沉淀是一種常用的蛋白質相互作用檢測方法。它利用特異性抗體與目標蛋白質結合，然后通過沉淀的方式將與目標蛋白質相互作用的蛋白質一同沉淀下來。通過檢測沉淀物中的蛋白質，可以確定目標蛋白質的相互作用伙伴。

　　2.酵母雙雜交

　　酵母雙雜交是一種基于酵母細胞的蛋白質相互作用檢測方法。該方法利用酵母細胞中的轉錄因子分為兩個部分，一個與目標蛋白質結合，另一個與啟動子結合。當目標蛋白質與其相互作用伙伴結合時，轉錄因子的兩個部分會重新組合，從而激活報告基因的表達。

　　3.表面等離子共振

　　表面等離子共振是一種基于光學原理的蛋白質相互作用檢測方法。該方法通過將目標蛋白質固定在金屬薄膜上，利用光的反射和透射來檢測蛋白質的結合情況。通過測量反射和透射光的變化，可以確定蛋白質的相互作用強度和親和力。

　　4.質譜分析

　　質譜分析是一種高靈敏度的蛋白質相互作用檢測方法。該方法通過將樣品中的蛋白質分離并離子化，然后利用質譜儀對離子進行檢測和分析。通過質譜圖譜的分析，可以確定蛋白質的相互作用伙伴和結合位點。