核酸與核酸互作：如miRNA和mRNA的結(jié)合可以調(diào)節(jié)基因表達(dá)，影響蛋白的表達(dá)、修飾和酶活性等。通過MS2-RIP和雙螢光素酶技術(shù)，可以詳細(xì)研究這些互作過程。

　　核酸與蛋白互作：這種互作廣泛存在于基因的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯和修飾等過程中。例如，RNA pull-down和染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)技術(shù)可以檢測(cè)DNA、RNA與蛋白質(zhì)之間的相互作用。

　　蛋白與蛋白互作：蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的執(zhí)行者，其相互作用可以形成復(fù)合體，從而執(zhí)行特定功能。免疫共沉淀(Co-IP)和酵母雙雜交技術(shù)可以用來檢測(cè)蛋白質(zhì)之間的直接或間接相互作用。