樣本鑒定到肽段數量統計圖可以看出一部分信息，但僅從數量來看，能看到的信息較少，重合性分析主要通過韋恩圖的方式來看組內和組間的肽段有無差異，可以分析出組內和組間的差異性。設置組內重復，可以看出哪些肽段是在制備方法中穩定存在的，這些肽段可能更具有深入研究價值;組間重合性分析則是可以看不同處理方式產生的肽段差異，可根據結果進一步調整或優化前處理方法。如果想做，樣品最低設置：組內是三個，組間至少兩組.