圓二色譜儀器利用光與物質相互作用產生的圓二色性現象來進行分析。當光線通過具有不對稱性的物質時，其左右旋光分量會產生不同程度的吸收或透射，從而形成圓二色性。通過測量不同波長下的圓二色性差異，可以獲得物質的結構信息。