流式細胞儀在細胞凋亡的研究和應用中廣泛應用。在腫瘤學中，流式細胞儀可以評估抗腫瘤藥物的療效，并預測腫瘤的預后。在免疫學中，流式細胞儀可以幫助研究免疫細胞的凋亡過程，了解免疫調節的機制。在炎癥疾病中，流式細胞儀可以檢測炎癥細胞的凋亡，評估炎癥的嚴重程度和疾病的進展。